Crystallogy es un mod que se basa en la cristalogía para permitirnos crear nuevos objetos, con habilidades especiales, mediante el uso de los cristales que añade el mod. Estos cristales podremos encontrarlos en el subsuelo de nuestros mundos. Una vez obtenidos los cristales podremos tratarlos con unas máquinas para poder empezar a trabajar con ellos.

Estos cristales nos permitirán crear hasta cinco variantes de armadura, que nos aportarán nuevas habilidades. También podremos utilizar los cristales para crear nuevas armaduras, e incluso para hacer Voodoo con las entidades del juego o con nuestros amigos en multijugador.