Tool Upgrades nos ofrece una buena cantidad de nuevos encantamientos, en este mod llamados modificadores para nuestras armas y herramientas. Dichos modificadores podrán aportarnos nuevas habilidades, o bien, ser encantamientos ya existentes en el juego, pero más poderosos que los predefinidos.

Los modificadores pueden ser aplicados en la mesa de crafteo, uniendo el artefacto a la arma o herramienta, o bien, uniendo el artefacto a un libro, para conseguir un libro encantado que encantará el arma o herramienta del mismo modo de siempre. Estos artefactos serán costosos de fabricar, pues las mejoras que aportan son importantes.